Kostel se v Unkovicích nacházel již ve 14. století. Do roku 1341 je datována první zpráva o místní faře. Unkovická farnost byla v roce 1633 přesunuta do Židlochovic a v současné době je filiálním kostelem židlochovické farnosti.  Nynější barokní podoba kostela, který je zasvěcen Nanebevzetí Panny Marie, pochází z roku 1767, kdy jej nechal přestavět a rozšířit Jan z Ditrichštejna. Jeho interiér byl naposledy upravován v 70. letech 20. století. Ve věži se nachází tři zvony z 16. a 17. století, oltářní obraz je z roku 1849.