V roce 1788 započala v katastru bývalé obce Stodůlky stavba dřevěného kostelíka, který byl o rok později, přesně 10. srpna, vysvěcen Prokopem Haurem ze Sušice. Dřevěná stavba však nebyla stavbou příliš dokonalou tak již v roce 1803 schvaluje císař František I. stavbu nového, tentokráte zděného kostela. Na tuto stavbu vymezuje 5.443 zlatých a 39 krejcarů. Navíc přidává i 701 zlatých na vnitřní vybavení. 1. května 1804 je proveden výkop a o dva dny později je pložen základní kámen kostela. Na stavbu, kterou provádí František Gruber ze Srní, Johann Schaler z Gerlovy Huti a Wenzel Haslinger ze Zelené Hory, dohlíží farář Wenzel Prinz. Mezi 5. a 7. zářím roku 1804 je již posazen krov a v oněch dnech se zakupují i varhany, velká monstrance a svícny. 7. března roku 1806 jsou do věže kostela umístněny dva zvony. Ten větší vážil 510 a menší 442 liber (1 vídeňská libra = 0,56 kg). 15. srpna téhož rku je kostel slavnostně vysvěcen Johanem Prokopem von Schaftgottsche.

Po 2. světové válce začal kostel chátrat. V 60. letech minulého století se uvažovalo dokonce o jeho demolici. Tato myšlenka však byla v bolestném roce 1968 zavržena. Rozhodlo se, že se kostel podrobí generální opravě. Tato oprava byla dokončena v roce 1970. K dalším výraznějším opravám dochází v roce 1991, kdy se částečně renovoval kostelní interiér. V roce 1995 přichází na řadu oprava střechy, okapů a omítky. V roce 1997 se restaurují kostelní varhany. V roce 2008 dochází k výměně starého krovu a střecha je osazena novou krytinou.

Zajímavosti:

3. listopadu roku 1833 srazila obrovská bouře orla z věže a poškodila báň. Orel na věži měl vůbec pohnutou historii - po dokončení oprav (1835) ze zmiňované bouře byl nahrazen železným křížem, aby se pak při další opravě v roce 1853 vrátil zpět na věž. V roce 1890 byl opět snesen za účelem jeho údržby. Navrácen byl téhož roku, přesně 23. září. V roce 1925 byl rakouský orel sňat ze špičky věže definitivně*. Nahradil ho železný kříž, který je na kostele dodnes. Původní zvony byly v roce 1916 (7. prosince) po hodinovém zvonění sňaty a odvezeny pro vojenské účely. Na Vánoce roku 1944 byla s velkými obtížemi dokončena elektroinstalace kostela. Na opravy v roce 1968 bylo vyčleněno ONV celých 1.000.000,- Kčs. V roce 1988 bylo instalováno elektrické natahování kostelních hodin, které se do té doby provádělo ručně - práce provedli František Březina ml. a Josef Hynek, oba obyvatelé Srní. Za rekonstrukci v roce 1995 bylo zaplaceno 182.000,- Kč. na tuto částku byl použit výtěžek dobrovolných dárců (27.000,- Kč), peněžní příspěvky od firmy KOMES a.s. Most (20.000,- Kč) a Římskokatolického úřadu v Kašperských Horách (55.000,- Kč). Zbytek pak doplatil OÚ Srní.

Na podzim roku 2003 poškodil silný vítr kostelní báň. Její oprava probíhala od 11. - 25. listopadu téhož roku. * Informace jsou čerpány z krátkého textového přehledu, který je umístněn u kostela. Nicméně nám histroie orla nekoresponduje s přiloženou pohlednicí, která by měla být z roku 1915. V té době by dle zmiňovaného textu měl orel být stále na věži, nicméně na pohlednici je již kostel se železným křížem. Najde se vysvětlení?