Obec vznikla  polovině 17. století. První písemná zpráva pochází z roku 1645 když správce novoměstského panství František Maxmilián Kratzer dovoli dělníkům, aby si na vykácené pasece „U třech studní″ postavili své chaloupky. Tato nejstarší část obce vznikla v zatáčce cesty k Fryšavě pod Žákovou Horou, kde ze třech studánek vyvěral potůček tekoucí do Medlovského rybníka. Tři Studně spadaly dříve k obci Fryšava pod Žákovou Horou, v roce 1992 se pak osamostatnily. Raritou obce je nejmenší náměstí v České Republice, které je také zapsané v České knize kuriozit a rekordů a rybník Sykovec na okraji obce, který vznikl mezi lety 1587-1646 a je tedy starší než samotná obec.

Na území dnes žije 103 obyvatel.