Až do 18. století se vyskytovalo pouze označení Chotětice, postupně se začalo užívat také názvu Choťánky. Proč došlo k záměně nebo užívalo-li se obou pojmenování současně, není z dostupných pramenů známo.  Z archeologických vykopávek realizovaných současně se stavbou okresní silnice od Vrčení do Choťánek vyšlo najevo, že obec Choťánky pochází ze stejné doby jako slavníkovská Libice. Byly současně objeveny i nálezy mnohem starší – kultury neolitické, Hallstadtské – předměty denního života, šperky, zbraně, keramika, způsob pohřbívání spalováním apod.  Choťánky byly původně rozloženy pravděpodobně při břehu Labe, které svůj tok časem změnilo a zůstaly pouze labské zátočiny.V 15. století společně vytvořily tehdy pro Poděbradsko typickou rozsáhlou rybniční síť. Současně daly vznik třem ostrovům a několika tvrzím. Zdejší tvrz je zmiňována v roce 1345 jako součást poděbradského panství a později se stala sídlem manů. Zanikla pravděpodobně při obléhání Poděbrad husity roku 1426 a přezdívalo se jí Kočičí hrádek. Proto se ve znaku obce objevuje tvrz s kočkou.  Od 14. století náležely Choťánky většinou pod správu poděbradského panství. Podél dnes již neexistujících tvrzí se po staletí až do současnosti rozkládala řada hospodářských stavení, usedlostí a statků. Lze tak soudit podle podrobného zápisu místní kroniky. Na počátku 20. století už měla obec 77 domů, 419 obyvatel, hostinec, kovárnu, školu, občanskou knihovnu, sbor dobrovolných hasičů.