Vznik obce Kšely se datuje od roku 1266, kdy je doložena první písemná zmínka o obci Kšely. V minulosti se Kšely dělily na Horní a Dolní Kšely. V roce 1480 větší byla větší část vesnice připojena k černokosteleckému panství. V roce 1552 připadla menší část obce svatovítské katedrále v Praze. Samostatnou obcí jsou Kšely od 1. ledna 1991.

Obec se dělí do několika lokalit. Směrem od Českého Brodu to jsou Uhlíkov, V Benátkách, Za Humny a Nad Vsí. Z geologického hlediska spadá do oblasti Kvartér Českého Masivu a Karpat. Geologické podloží obce tvoří především nezpevněné naváté sedimenty spraše a sprašové hlíny, částečně sedimenty zpevněné jako je pískovec, prachovec, slepenec a uhlí, jak dokazuje obrazová příloha č. 1. Podél Chotýšského potoka se nacházejí i nepropustné jílovcové plochy. Zemědělská půda zaujímá 390 ha a lesní půda 15 ha (2010). Orná půda zabírá více než 80 % plochy katastrálního území, tj. 367  ha (2010), ovocné sady 1 ha (2010), trvalé travní porosty 18 ha (2010). Obec nejsou založeny chmelnice ani vinice. Vodní plocha obce tvoří 4 ha (2010). Obcí protéká potok Chotýšský a nad obcí potok Bylanka.