Není přesně známo, kdy obec Klášterní Skalice vznikla, nejstarší písemné zprávy pocházejí z 8. století. První zmínka o Klášterní Skalici je z roku 1345. Původ názvu vychází zřejmě od množství skal, které okolo břehů Kouřimky vystupují. Název Klášterní jí byl připojen až v pozdější době, když zde byl vystavěn cisterciácký klášter. Klášter založil roku 1357 kancléř císaře Karla IV. mindenský biskup Dětřich a je nejmladším cisterciáckým klášterem na našem území. Po nájezdu husitských houfů v roce 1421 klášter vyhořel a přestal existovat. Jsou dochovány zříceniny klášterního chrámu Panny Marie a konventních budov. Z kostela zbývá torzo jihovýchodního pilíře křížení vystupující do výše asi 10 metrů. Je z tesaného pískovce.

Od roku 1990 je Klášterní Skalice samostatnou obci a pracuje zde obnovený obecní úřad.

Žije zde 139 obyvatel.