Osada na levém břehu potoka Výrovka leží v jedné z nejdéle Slovany osídlených oblastí Čech, jejímž hlavním střediskem bývalo hradiště v Kouřimi. Nedaleko od vsi se nacházelo další slovanské hradiště na Šancích u Radimi. V roce 1416 je v kouřimské městské knize zmiňován jakýsi Štěpán sídlící v Chotuticích, z čehož lze usuzovat, že ve vsi tehdy pravěpodobně stál vladycký dvorec. Od šestnáctého století sdílely Chotutice osudy statku Radim, jehož majiteli byli až do konfiskace roku 1631 Zárubové z Hustířan. Později radimský velkostatek po dlouhou dobu patřil k lichtenštejnskému dominiu. Ve vsi, která byla přifařena k faře Skramníky, vznikla v roce 1805 nevelká kaple. Koncem devatenáctého století žilo v Chotuticích necelých osm set obyvatel. V současnosti je jejich počet o více než tři sta osob nižší.