Obec - osada vznikla ve druhé polovině 13.století a první historické zmínky o ní pocházejí z roku 1252. V osadě byla založena tvrz pod kterou patřila celá ves Kouty. Až do roku 1850 se zde střídali majitelé. Posléze byly Kouty zahrnuty do politického a soudního okresu Ledeč nad Sázavou.

Na návsi pod starou lípou si věřící postavili kamenný kříž. Na kmeni lípy je zavěšen zvon. Další kamenný kříž je v Chalupách. Oba kříže jsou ukázkou umělecké práce místních kameníků. Mezi léty 1787-1789 vznikla na okraji vsi sklárna.

Rok 1868 je rokem první zmínky o škole. Byla provozována v opravené místní pastoušce. Pro velký počet dětí byla zřízena v roce 1889 další třída v domě A. Meda. Vzhledem k neustále rostoucímu počtu dětí bylo rozhodnuto postavit novou Školu. Byla postavena v dolní části obce. Učilo se zde až do roku 1976, kdy byla pro malý počet žáků uzavřena. Děti od té doby dojíždějí do školy v Ledči n. S. Škola však nezůstala prázdná. Dnes je zde sídlo obecního úřadu, klubu přátel hasičů, posilovna, knihovna a ve své podstatě se stala kulturním střediskem obce.

Původní název Kout se v roce 1886 změnila na Kouty. Od roku 1925 patřily Kouty pod obecní úřad v Kamenné Lhotě, povoleni k samostatné správě získaly Kouty až v roce 1938.

V poválečných letech bylo v obci založeno jednotné zemědělské družstvo.V roce 1976 se sloučilo ve velký celek s družstvy Kožlí a Bojiště. Obec Kouty byla opět sloučena s obcí Bojistě, kde rovněž byl Místní národní výbor. K osamostatnění došlo až v roce 1990. Obecní zastupitelstva v následujících letech rozhodovala o dalším rozvoji obce. Byla provedena rekonstrukce obecní školy v jejichž prostorách našlo umístění jak obecního úřadu tak i posilovny, knihovny a restaurace. Byl vybudován obecní vodovod jako náhrada za několik skupinových vodovodů a pro zajištění kvality vody byla vybudována odradoňovací stanice. V následujících volebních obdobích byla provedena rozsáhlá úprava prostor v dolní Části obce včetně opravy požární nádrže. Vznikl tak vhodný prostor pro pořádání různých společenských aktivit.