Převážně zemědělská obec je historicky spjata s tvrzí ze 13. století, jejíž pozůstatky se nalézají severovýchodně od obce na místě zvaném Na Valech.

První písemná zmínka o vesnici Mnichovice pochází z roku 1350. V dochovalé listině se o Mnichovicích píše o vsi jako o hotové. Rok 1352 je již spjat s existencí kostela svatého Filipa a Jakuba.

Mnichovice byly od počátku statkem biskupským, posléze majetkem arcibiskupství pražského. Později byli majiteli vsi páni Trčkové z Lípy a Střelové z Rokyc.

V roce 1627 opustil mnichovickou faru poslední farář.