Přestože Kundratice vznikly s největší pravděpodobností někdy v polovině 13. století, díky kolonizátorským aktivitám Štěpána z Medlova, první písemná zmínka o této obci pochází až z roku 1363 a nachází se na pergamenové listině abatyše doubravnického kláštera, Kláry Markyty, která věnuje touto listinou, mimo jiné, obec Kundratice  klášteru a stanovuje práva a povinnosti místnímu rychtáři. V průběhu staletí zažily Kundratice i jejich obyvatelé spoustu dobrých i špatných období a pánů, podle toho, jak bylo převáděno bystřické panství, a rozrostly se do dnešní podoby.

V roce 1643 bylo 10 domů osedlých, roku 1663 jen 4 osedlé a 9 pustých, roku 1790 domů 34 a obyvatel 193. V roce 1834 bylo v Kundraticích 34 domů a 272 obyvatel, roku 1900 domů 46 a 241 obyvatel, z nich 207 katolíků a 34 evangelíků.

Po Kundraticích se psal roku 1490 Mašek, jež koupil od Krištofa z Vojetína jeho dvůr ve Vojetíně. Ves však náležela roku 1500 pánům z Pernštejna a to ke zboží jejich Bystřickému, u něhož stále trvala.

Roku 1500 osvobodil Vilém z Pernštejna Kundratice od povinného čepování panského vína a roku 1515 od bezplatného vožení panských ryb. Stará pečeť obecní má ve znaku růži a nápis „Dedina Kundratice“.

V obci je kaplička, která se stavěla roku 1863 až 1872, plány zhotovil mistr Cejnek z Bobrové, práce i kámen dali občané zdarma. Byla vysvěcena sv. Josefu. Když se v roce 1929 opravovala, byl na památku výročí smrti sv. Václava zakoupen oltářní obraz tohoto světce. 29. září 1929 tam byly slouženy bohoslužby a byla to první pouť v Kundraticích.

Roku 1858 byly vydány komise na hřbitovy a evangelíci od katolíků odděleni. Evangelíkům bylo vyměřeno místo na Lukášově poli nad vesnici a hned roku 1859 tam museli hřbitov postavit a na něm se pohřbívat. V obci byla stará rychta.

Okrouhlou náves obklopily rodinné domy, ze spodní části obce časem zmizela velká rychta, uprostřed návsi byla v roce 1863 až 1872 vystavěna kaplička, v roce 1929 byla do obce zavedena elektřina, v roce 1953 byla na místě chudobince postavena hasičská zbrojnice, v roce 1957 byl do Kundratic zaveden první vodovod a v roce 1997 byla obec zplynofikovaná.