Původně dřevěný farní kostel sv. Maří Magdaleny se samostatnou zvonicí je doložen už ve 14. století. V letech 1590 - 96 byl na jeho místě postaven nový. Pozdně gotickou síňovou stavbu financoval majitel panství Oldřich Felix z Lobkovic, ten také kostelu věnoval stříbrnou pozdně gotickou monstranci od zlatníka Tomáše Poláka z Malé Strany, kterou později vykoupilo město. Iluminovaný graduál, bohatě zdobenou knihu liturgických zpěvů věnoval kostelu jeho nástupce Václav z Lobkovic. V druhé pol.19. století byly zbourány kaple, v 19. století byla snížena věž a po zřícení klenby lodi v roce 1885 byl kostel opravován podle návrhu Josefa Mockera. V letech 1936- 40 byla obnovena klenba ze železobetonu. 

Kostel má mimořádné, pozdně barokní, vybavení interiéru, z dílny sochařů Jelínků z Kosmonos. Obraz sv. Maří Magdaleny na hlavním oltáři je připisován J. P. Molitorovi a datován kolem roku 1752. Po jeho stranách stojí sochy sv. Václava a sv. Anny. Interiér kostela zdobí také kazatelna se sochami čtyř evangelistů, Krista Vítězného a reliéfem Posledního soudu od J. Jelínka ze stejné doby. Funkční jsou rokokové varhany z roku 1748 od varhanáře Tuchmanna z Labského Týnce s bohatou figururální výzdobou z dílny Jelínků. Na stěně presbytáře jsou umístěny tři náhrobky lobkovických dětí z let 1581, 1596. Těmi se nechal inspirovat sochař Otto Guttfreund při vytváření známého sousoší Babička s vnoučaty, umístěného v Ratibořicích. V kryptě pod kostelem je pohřbena významná část rodu Netolických: Václav Kazimír Netolický - ministr Marie Terezie, autor pozemkové reformy v 18. století - pohřben v r.1760  a Jan Adam Netolický - majitel panství, pohřben v r.1769 Eugen Vratislav z Mitrovic Netolický - slavný rakouský vojevůdce, pohřben v r.1867. 

U kostela se nachází budova fary (Děkanství a sídlo Oblastní charity Sobotka) - významná zejména původní střechou ze 16. století s rokokovými štíty. 

Kostel není volně přístupný, mimo bohoslužeb ho lze navštívit pouze při příležitosti koncertů duchovní  hudby, které se konají během letní turistické sezony.