Synagoga byla vystavěna v roce 1868 nákladem tehdejšího starosty židovské obce Davida Kuffnera. O dvacet let později (v roce 1888) byla přestavěna podle projektu vídeňského architekta Maxe Fleischera v novorománském slohu s maurskými prvky. Svému účelu sloužila až do roku 1938. Později byla využívána jako skladiště. V roce 2000 byla rekonstruována a v současné době je využívána pro výstavní účely.

V objektu se nachází stálá expozice věnovaná zdejší židovské komunitě, jejíž počátky lze doložit již ve 14. století. Stala se neodmyslitelnou součástí Břeclavi a formovala zde nejen hospodářský, ale i kulturní, společenský a politický život města. Její zánik pak přivodily tragické události druhé světové války.