Železniční zastávkou Brno-Černovice prochází trať č.340 Brno hl.n. - Uherské Hradiště, tzv. Vlárská dráha. Kdysi to bývala významná stanice. Vypravovaly se odsud vlaky místní dráhy do Líšně. V roce 1942 byla tato dráha předána pod správu Společnosti brněnských elektrických drah a význam stanice opadl.
Dnes stanicí vlaky většinou projíždějí. Zastavují zde jen ranní vlaky jedoucí do Brna a jeden vlak odpolední, jedoucí z Brna. Stanice je bez obsluhy a to se odráží i na jejím vzhledu.