Kostel svatého Jakuba byl po dlouhou dobu dominantou návrší parku nad řekou nežárkou v severní části města. Po založení lespoarku se bohužel pomalu ztratil mezi vzrůstajícími stromy. Po konci osmnáctého století začala hradecká armádní posádka využívat původně gotický kostelík jako skladiště střelného prachu. Stavba byla v polovině devatenáctého století stržena a na jejím místě byl vystavěn kostel v novogotickém slohu. V té době pod ním nechal hrabě Černín zbudovat rodinnou hrobku. Od poloviny dvacátého století nebyl objekt udžován a v současné době je poměrně zchátralý.